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华大时空组学,时空组学要解决的问题

与其他组学技术相比,时空组学解决了组织中细胞的空间分布及其随时间变化的问题,是推进脑科学和脑疾病研究的重大进展。华大生命科学研究所时空组学首席科学家陈敖发布2024年新产品。为了帮助研究人员更好地利用前沿算法工具开展研究,华大时空组学邀请了“GigaScience”的主要研究人员》和《GigaByte》时空组学算法工具专题,分享最新发布的时空组学数据算法工具。加工中的应用。

2017年,蒲慕明院士作为核心成员加入华大研究院等机构发起的时空组学联盟(STOC),携手全球190余位顶尖科学家,共同推动脑科学关键问题的解答。联盟成立之初,华大基因就联合南方科技大学等单位构建了模式生物果蝇晚期胚胎和幼虫的3D时空发育图谱,识别了果蝇中肠发育的空间分区,分析了幼虫睾丸细胞的命运。转型。



时空组学联盟



1、时空组学联盟

作为时空组学领域的重要推动者,华大基因在2020年发布了自主研发的时空组学技术Stereo-seq。华大时空组学STOmics应运而生,助力生老病死、意识起源、成长万物之源、生命起源等重大科学问题的研究与应用,推动生命科学领域第三次科技革命。问:2022年5月,时空组学联盟宣布成立。迄今为止,已有来自30个国家的190多名科学家加入。我们目前所做的各种组学研究都是在固定的采样时间下进行的,没有精确的细胞空间分布。



时空组学芯片



2、时空组学芯片

因此,当我们想要对细胞进行分类时,如果不加上时间的因素,无法了解每个时间点的转录组,就没有办法真正进行分类。其中,时空转录组FFPE产品解决方案基于随机探针原位捕获,可以在同一切片上实现HE染色和基因表达分析。最近发表了大量高分空间组学技术文章。您是如何取得这些令人印象深刻的成果的?



时空组学最新研究成果



3、时空组学最新研究成果

时空组学技术就像一台兼具超广角和百亿像素的生命相机。它可以完整捕捉组织中每个细胞的遗传信息和空间位置。被联盟成员广泛应用于胚胎发育、器官再生等过程的观察。利用时空组学技术,科学家记录了小鼠如何在母体内一步步发育出复杂的器官。该结果将为哺乳动物发育研究提供重要的数据参考,帮助我们更好地了解胚胎生长和器官发生,也为出生缺陷的研究提供指导。

2020年1月5日,与时俱进,——2024时空组学用户峰会植物研究将在三亚举办。时空组学联盟可与上世纪三大科学工程之一的人类基因组计划相媲美。当时的人类基因组计划也是一个联盟,有六个国家的科学家参与。如今,时空组学联盟拥有来自30 个国家的科学家。超过260名顶尖科学家加入,横跨生物学、数学、物理、化学、工程和计算机等多个学科。

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